Los estudiantes egipcios, tanto los becados como aquellos que se mantienen por sus propios medios, están bajo la supervisión científica de la Administración General de Misiones, organismo dependiente del Ministerio de Educación Superior. El número de estudiantes que el Instituto ha supervisado durante los sesenta años transcurridos desde su fundación llega casi a mil quinientos, pertenecientes a diversos ámbitos de las ciencias, las artes y las humanidades, entre ellos, por ejemplo: ingeniería, arquitectura, agricultura, medicina, veterinaria, oftalmología, estomatología, turismo, ciencias económicas y empresariales, derecho, literatura árabe y española, historia, arte dramático, cine, etc.
De entre los asuntos de los que se ocupa también el Instituto Egipcio es promover la cooperación científica e investigadora entre las universidades egipcias y españolas, intermediando para la firma de nuevos convenios interuniversitarios y también para la renovación y activación de los ya existentes.